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焦雨铃研究组在选择性剪切对拟南芥蛋白质多样性贡献研究中取得进展

  选择性剪切是一种重要的调控机制,能够增加转录组和蛋白质组的多样性。近年来基因组水平的研究极大地拓展了大家对植物中选择性剪切发生频率的估计。最新的研究发现超过60%的含有内含子的基因可以发生选择性剪切。但是选择性剪切得到的mRNA可能仅仅是不完善加工的前体mRNA。大家仍不知道有多大比例的选择性剪切事件可以导致蛋白质组的多样性。 

 

  焦雨铃研究组在全基因组水平通过分析与核糖体结合的mRNA来研究翻译组的构成,并与总mRNA所代表的转录组进行了比较。该研究发现有35%的选择性剪切事件能够被翻译,并且其中大部分(81%)会导致蛋白质编码能力的多样化。同时,该研究发现一些弱翻译的选择性剪切mRNA可能通过无义介导的mRNA降解途径降解,非翻译的选择性剪切mRNA则不通过此途径降解。该研究报道了植物选择性剪切对蛋白质组多样性的贡献,并分析了植物与动物中可变剪切的区别。 

 

  该研究成果于201652日发表于《分子植物》(Molecular Plant)上(DOI: 10.1016/j.molp.2015.12.018)。该项目得到了科技部、自然科学基金委、及植物基因组学国家重点实验室的资助。焦雨铃研究组的博士研究生于浩澎和副研究员田彩环博士为该文章的共同第一编辑。 

    

. 选择性剪切对蛋白质多样性的作用 

    

 
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